Palestrantes

Marisa Fabiana Nicolás

LNCC - Laboratório Nacional de Computação Cientifica

Marisa Fabiana Nicolás - Biografia

Bióloga (Buenos Aires, Argentina, 1991) com mestrado em Genética pela Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho (UNESP, 1996) e doutorado em Genética pela Universidade Federal do Paraná (UFPR, 2001). Concluiu seu pós-doutorado (CNPq) na Embrapa Soja em 2005. De 2005 a 2007, trabalhou como anotadora de proteínas no banco de dados UniProt/Swiss-Prot. Desde maio de 2009, é Pesquisadora Associada no Laboratório de Bioinformática (Labinfo) no LNCC/MCTI e Professora Permanente da Pós-Graduação em Modelagem Computacional nesta instituição, que possui conceito CAPES 7. Marisa é bolsista de Produtividade em Pesquisa do CNPq (nível 2) na área de Genética e Cientista do Estado pela FAPERJ. Possui vasta experiência em Genética, Biologia Molecular, Genômica e Bioinformática. Sua atuação principal é em Bioinformática aplicada à análise de genomas, transcriptomas (RNAseq) e redes metabólicas e regulatórias, com foco na priorização de alvos moleculares em patógenos de relevância clínica.

Gabriel da Rocha Fernandes

FIOCRUZ - Fundação Oswaldo Cruz

Gabriel da Rocha Fernandes - Biografia

Bacharel em Ciências Biológicas (2006) pela Universidade Federal de Minas Gerais concluiu o doutorado em Bioinformática (2011) pela mesma instituição. Durante o doutoramento passou pelo European Molecular Biology Laboratory EMBL (2009-2010), em Heidelberg na Alemanha, sob a orientação do Dr. Peer Bork, referência em estudos genômicos e metagenômicos. Entre 2011 e 2014 foi responsável pela plataforma de Bioinformática do programa de Ciências Genômicas e Biotecnologia da Universidade Católica de Brasília. Em 2015 começou a carreira como Pesquisador em Saúde Pública no Instituto René Rachou Fiocruz Minas. Em 2018 tornou-se pesquisador associado ao Centro De Pesquisas Metabólicas Básicas da Universidade de Copenhagen. É membro do corpo permanente dos programas de pós-graduação em Bioinformática (UFMG) e em Ciências da Saúde (Fiocruz).

Maurício Egídio Cantão

EMBRAPA - Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária

Maurício Egídio Cantão - Biografia

Graduação em Processamento de Dados pela Faculdade de Tecnologia, FATEC (2001), Especialista em Bioinformática pelo Laboratório Nacional de Computação Científica (LNCC-2002). Doutor em Bioinformática pelo Instituto de Matemática e Estatística (IME-USP-2009). Pós-doutorado em Bioinformática no Laboratório Nacional de Computação Científica (Labinfo/LNCC-2009-2011). Pesquisador em Bioinformática na Embrapa Suínos e Aves (CNPSA), Concórdia/SC. Tem experiência na área Genômica, Transcriptoma, Metagenômica e RNA-Seq.

Mariana Lima Boroni Martins

INCA - Instituto Nacional de Câncer

Mariana Lima Boroni Martins - Biografia

Pesquisadora titular do Instituto Nacional de Câncer (INCA), Líder do Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional; Docente do Programa de Pós-Graduação em Oncologia do INCA; Bolsista FAPERJ programa Jovem Pesquisadora de Nosso Estado e Bolsista Produtividade CNPq Nível 2; Co-Fundadora da Startup OneSkin. Possui graduação e mestrado em Bioquímica pela Universidade Federal de Viçosa, doutorado em Bioinformática pela Universidade Federal de Minas Gerais (com período de sanduíche no NIH - National Institute of Health, Bethesda, Estados Unidos). Teve experiência profissional em Bioinformática durante seu pós-doutorado no Gene Center na Ludwig Maximilian München University, Alemanha e no Center for Computational Biology do Cancer and Genomic Sciences Institute - University of Birmingham, Inglaterra, como Pesquisador Visitante.

Maiana de Oliveira Cerqueira e Costa

LNCC - Laboratório Nacional de Computação Cientifica

Maiana de Oliveira Cerqueira e Costa - Biografia

Doutora em Modelagem Computacional pelo Laboratório Nacional de Computação Científica (LNCC) com um período-sanduíche na Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM) na cidade de Cuernavaca, México. Obteve o título de Mestre em Modelagem Computacional também no Laboratório Nacional de Computação Científica. Bacharel em em Ciências Biológicas pela Universidade Federal da Bahia (UFBA) e desde 2005 atua nas áreas de Bioinformática, Modelagem Computacional, Genômica e Biologia Molecular aplicadas a patógenos, com destaque para projetos envolvendo genômica comparativa e reconstrução de redes metabólicas e regulatórias da bactéria clinicamente relevante Staphylococcus aureus. Atualmente trabalha como bolsista PCI-DB do Laboratório Nacional de Computação Científica com a integração de dados provenientes de redes biológicas para a identificação de novos alvos terapêuticos em patógenos humanos.

Otavio José Bernardes Brustolini

LNCC - Laboratório Nacional de Computação Cientifica

Otavio José Bernardes Brustolini - Biografia

Graduação em Biologia com ênfase em Genética e Biologia Molecular, mestrado em Microbiologia e Doutorado em Bioquímica com ênfase em Biologia Molecular pela Universidade Federal de Viçosa/MG. Experiencia em bioinformática na análise de transcritômas e exomas aplicando métodos estatísticos clássicos e aprendizado de máquina e aprendizado profundo na detecção de padrões na expressão gênica. Também tenho experiência em linguagens de programação R, C/C++ e Python 3. Atualmente é desenvolvedor pleno na área de aprendizado de máquina e aprendizado profundo (AMAP) no Laboratório de Bioinformatica (LABINFO) do Laboratório Nacional de Computação Cientifica (LNCC).

Pablo Ivan Pereira Ramos

FIOCRUZ - Fundação Oswaldo Cruz

Pablo Ivan Pereira Ramos - Biografia

Bacharel em Ciências Biológicas pela Universidade Federal da Bahia, Doutor em Modelagem Computacional, na linha de pesquisa em Bioinformática, pelo Laboratório Nacional de Computação Científica (Petrópolis, RJ), instituição onde também obteve título de Mestre. Realizou parte de seu treinamento científico na Fachhochschule Gelsenkirchen (graduação-sanduíche), em Gelsenkirchen, Alemanha; na Université Claude Bernard Lyon 1, em Lyon, França (mestrado-sanduíche); e na Universidad de Buenos Aires, em Buenos Aires, Argentina (doutorado-sanduíche).Desde 2005 desenvolve pesquisa na área de bioinformática e genômica/transcritômica aplicada ao estudo de patógenos clinicamente relevantes.

Ernesto Perez-Rueda

UNAM - Universidad Nacional Autónoma de México

Ernesto Perez-Rueda - Biografia

Ernesto Pérez Rueda tiene una licenciatura en Biología por la Facultad de Ciencias-UNAM; es maestro en Investigación Biomédica Básica y doctor en Ciencias Biomédicas por el Centro de Investigación sobre Fijación de Nitrógeno-UNAM. Su área de especialidad es la Bioinformática, en particular se ha ocupado de la comparación y reconocimiento de patrones para identificar elementos proteicos que definen el destino de la expresión genética en microorganismos y, adicionalmente, junto con su equipo, ha desarrollado un enfoque novedoso en la comparación de vías metabólicas, lo cual les permitió colaborar con grupos internacionales. Sobre estos temas ha publicado más de 90 artículos científicos y dirigido tesis de licenciatura, maestría y doctorado. En 2019 fue distinguido como Research Fellow del Centro de Genómica y Bioinformática de la Universidad Mayor, en Chile.

J. Eduardo Martinez Hernandez

CGNA - Centro de Genómica Nutricional Agroacuícola

J. Eduardo Martinez Hernandez - Biografia

El Dr. J. Eduardo Martinez Hernandez es Licenciado en Biotecnología Genómica, egresado de la Universidad Autónoma de Nuevo León, México. Sus estudios de Doctorado los realizo en la Universidad Mayor, Chile, obteniendo el grado de Doctor en Genómica Integrativa. Donde, estudio los cambios en la regulación transcripcional ocurridos en la interacción entre patogeno-hospedero para identificar nuevos blancos terapéuticos para tratar la enfermedades infecciosas. Desde el 2023 se incorporó como Investigador de tiempo completo a la Unidad de Genómica y Ciencia de Plantas del Centro de Genómica Nutricional Agroacuícola, Temuco, Chile. Sus líneas de investigación se centran en el área de la Genomica, Bioinformática, Biología computacional, enfocadas en estudiar la cambios en la regulación genica a diferentes niveles asociados a la interacción interespecie, principalmente entre planta-patógeno y planta-bacterias benéficas. Pertenece además, al directorio de la Sociedad Chilena de Bioinformática.

Edgardo Galán Vásquez

UNAM - Universidad Nacional Autónoma de México

Edgardo Galán Vásquez - Biografia

El Dr. Edgardo Galán Vásquez es Ingeniero Químico con Especialidad en Alimentos, egresado del Instituto Tecnológico de Oaxaca, México. Estudio la Maestría y el Doctorado en Ciencias en la Especialidad de Biotecnología de Plantas en el Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del Instituto Politécnico Nacional - Unidad Irapuato, México. Donde, estudio la topología y evolución de las redes de regulación transcripcional de bacterias endosimbiontes. Posteriormente, realizó una estancia postdoctoral en el Instituto de Física de la Universidad Autónoma de San Luis Potosí estudiando la dinámica y criticalidad de las redes de regulación genética. Además, realizó una segunda estancia posdoctoral en el Instituto de Investigaciones en Matemáticas Aplicadas y en Sistemas de la UNAM donde realizó el procesamiento de datos por medio minería de datos y estudiando redes de co-expresión genética.

Pablo Smircich Ruzo

UDELAR - Universidad de la República de Uruguay

Pablo Smircich Ruzo - Biografia

Desde los inicios de su carrera como investigador, ha trabajado en el campo de la parasitología, particularmente enfocado en el estudio de tripanosomátidos y otros parásitos de importancia sanitaria en la región. Su investigación se centra principalmente en los aspectos moleculares y genómicos de parásitos, habiendo contribuido a la comprensión de la regulación de la expresión génica y la biología del ARN en estos organismos. Actualmente, desarrolla su trabajo de investigación como responsable del Laboratorio de Bioinformática del Departamento de Genómica del IIBCE y en la Sección Genómica Funcional de la Facultad de Ciencias de la Universidad de la República de Uruguay (UDELAR, Montevideo).

Marcelo Marti

UBA - Universidad de Buenos Aires

Marcelo Marti - Biografia

Marcelo Martí (buenos Aires 11 de Julio de 1979), es licenciado y Doctor en Ciencias Biológicas de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales de la Universidad de Buenos Aires, donde actualmente es Profesor Adjunto. Es Investigador Principal del CONICET y su linea de trabajo principal comprende el desarrollo y aplicación de tecnología genómica y bioinformática en salud humana. Ha publicado mas de ciento cincuenta artículos en revistas internacionales de alto impacto, varios artículos de divulgación y dirigido numerosos estudiantes de doctorado. En 2012 fue distinguido con el premio Tr35 Argentina-Urugay, entregado por la prestigiosa revista Technology Review, en 2013 con el premio estimulo de la academia nacional de ciencias exactas fisicas y naturales, en 2017 con el premio de la academia nacional de ciencias y en 2019 con el premio Houssay al Investigador de la Nación. Es cofundador y actual director científico de Bitgenia.

Darío Fernandez Do Porto

UBA - Universidad de Buenos Aires

Darío Fernandez Do Porto - Biografia

Dario Fernandez Do Porto es investigador bioinformático con un doctorado por la Universidad de Buenos Aires (UBA) y una destacada trayectoria en el análisis de datos ómicos de patógenos y su integración con la biología de sistemas y la biología estructural para el desarrollo de nuevos fármacos. Actualmente, es Investigador Independiente del CONICET en el Instituto de Cálculo de la UBA, liderando el grupo de bioinformática. Es profesor de la UBA. Además, ha tenido una destacada participación en importantes proyectos de transferencia de tecnología al sector productivo.

Adrian Gustavo Turjanski

UBA - Universidad de Buenos Aires

Adrian Gustavo Turjanski - Biografia

Adrián Turjanski obtuvo su Maestría en Química de la Universidad de Buenos Aires en Argentina en 1999, y luego su Doctorado en Biofísica en 2003. Realizó estudios postdoctorales en el área de modelado molecular de 2003 a 2005 en el Departamento de Fisiología y Biología Molecular, Facultad de Ciencias, Universidad de Buenos Aires. Luego realizó un trabajo postdoctoral en Bioinformática como becario latinoamericano Pew 2005 en el Instituto Nacional de Investigación Dental y Craneofacial de los Institutos Nacionales de Salud, Bethesda, Estados Unidos. En 2008 regresó a Argentina donde está a cargo del Laboratorio de Bioinformática Estructural, en la Facultad de Ciencias de la Universidad de Buenos Aires. Forma parte del equipo de investigación del Consejo Nacional de Investigación y Tecnología (CONICET) como Investigador Independiente.

Uriel Alonso Hurtado Páez

UNAL - Universidad Nacional de Colombia

Uriel Alonso Hurtado Páez - Biografia

Bacteriólogo, Magister y Doctor en Biotecnología de la Universidad Nacional de Colombia, con 11 años de experiencia en análisis de datos genómicos de importancia agrícola y de salud humana. Investigador y docente de la Corporación para Investigaciones Biológicas enfocado principalmente en estudios genómicos comparativos asociados a la prevalencia y a la resistencia a antibióticos en Mycobacterium tuberculosis.

Elmer Andrés Fernández

CONICET - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas

Elmer Andrés Fernández - Biografia

Elmer Andrés Fernández es Ingeniero Biomédico por la Universidad Nacional de Entre Ríos (Argentina). Obtuvo su doctorado en Computación Avanzada e Inteligencia Artificial en la Universidad de Santiago de Compostela (España, 2003). Realizó su postdoctorado en la Universidad de Antwerp (Bélgica), especializado en ciencia de datos y bioinformática en toxicogenómica. Actualmente, es director del laboratorio de ciencia de datos e inteligencia artificial traslacional (DataLab) de la Fundación para el Progreso de la Medicina y se desempeña como Investigador Independiente de CONICET. Ha desarrollado avanzados algoritmos basados en IA y ML para el análisis de datos ómicos y la medicina de precisión. Además, asesora a empresas de base tecnológica e instituciones de salud en ciencia de datos y el desarrollo de aplicaciones de IA y ML para la medicina de precisión basada en técnicas genómicas.

André Borges Farias

LNCC - Laboratório Nacional de Computação Cientifica

André Borges Farias - Biografia

Graduação sanduíche em Licenciatura em Química (2012) pela Universidade de Coimbra e pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (2014). Mestre em Ciências (2017) pelo programa Produtos Bioativos e Biociências pela Universidade Federal do Rio de Janeiro. Doutor em Química (2022) pelo Programa de Pós-Graduação em Química na Universidade Federal do Rio de Janeiro. Atualmente é pós-doc no Laboratório Nacional de Computação Científica (LNCC). Possui experiência na área de química medicinal, com ênfase em modelagem de proteínas, docking molecular e simulação por dinâmica molecular. Interesses na área de aprendizado de máquina e cálculos de energia livre.

Miranda Clara Palumbo

UBA - Universidad de Buenos Aires

Miranda Clara Palumbo - Biografia

Licenciada en Ciencias Biológicas por la Universidad de Buenos Aires (UBA) y becaria doctoral del Instituto de Cálculo (CONICET). Su investigación se centra en la exploración de nuevos compuestos antibacterianos para el tratamiento de infecciones causadas por los patógenos Pseudomonas aeruginosa y Listeria monocytogenes, bajo la dirección de los Dres. Darío Fernández Do Porto y Mercedes Palomino. Además, se desempeña como Ayudante de Primera en la UBA, dictando cursos de grado y posgrado en el área de Bioinformática.

Leonardo Ledesma Domínguez

UNAM - Universidad Nacional Autónoma de México

Leonardo Ledesma Domínguez - Biografia

Es ingeniero en Computación con especialidad en Ingeniería Biomédica y maestro en Ciencias e Ingeniería por la UNAM, ambos grados obtenidos con mención honorífica. Recientemente ha finalizando el Doctorado en Ciencia e Ingeniería de la Computación en la UNAM, con un enfoque en la inteligencia artificial y ciencias genómicas, con la intención de buscar nuevas maneras rápidas y confiables para la predicción de factores de transcripción. En su labor docente, es profesor en la Facultad de Ingeniería de la UNAM, donde imparte las asignaturas de Lenguajes Formales y Autómatas. Es creador y colaborador del sistema CVICOM COVID-19, utilizado para el diagnóstico oportuno de dicha enfermedad, que actualmente está en uso en más de 300 hospitales en México. También ha contribuido en la creación de otros sistemas, como el “SIES”, cuyo objetivo es la evaluación y seguimiento de la Educación Superior. Cuenta con alrededor de 10 publicaciones y participaciones en eventos académicos y científicos, tant

Guadalupe Nibeyro

UCC - Universidad Católica de Córdoba

Guadalupe Nibeyro - Biografia

Guadalupe Nibeyro obtuvo su título de grado en Bioquímica en la Facultad de Ciencias Químicas de la Universidad Católica de Córdoba en febrero de 2010. Posteriormente, continuó su formación de posgrado en la misma institución, completando la Especialización en Bioquímica Clínica con orientación en Hematología en diciembre de 2014. Cursó el Doctorado en Ciencias Químicas en la Universidad Nacional de Córdoba, bajo la dirección del Dr. Elmer A. Fernández. Su investigación doctoral se centró en el "Estudio de variantes estructurales genómicas generadoras de neoantígenos de relevancia como biomarcadores en inmunoterapia tumoral", un área de creciente importancia en la oncología moderna. Además de su formación académica, Nibeyro tiene experiencia laboral en la Fundación para el Progreso de la Medicina, específicamente en el DataLab.

Juan Trinidad

UDELAR - Universidad de la República de Uruguay

Juan Trinidad - Biografia

Mi trabajo se centra en el desarrollo de flujos de trabajo para la anotación funcional de proteinas de kinetoplástidos utilizando métodos de homología remota con énfasis en la comparación de estructura de proteínas. A su vez, trabajo en proyectos con perfil evolutivo tanto en kinetoplastidos como en diferentes organismos eucariotas. Actualmente me desempeño como docente en el Laboratorio de Genómica Evolutiva de la Facultad de Ciencias de la Universidad de la República de Uruguay y como estudiante de Doctorado del Laboratorio de Bioinformática del Departamento de Genómica del IIBCE.

Carolina Albuquerque Massena Ribeiro

LNCC - Laboratório Nacional de Computação Cientifica

Carolina Albuquerque Massena Ribeiro - Biografia

Biologa pela ESALq-USP. Atualmente cursando mestrado em Modelagem Computacional no Laboratório Nacional de Computação Científica (LNCC), onde sou bolsista nota 10 da FAPERJ e sou parte do projeto de pesquisa: Bioinformática e Biotecnologia aplicadas na seleção e validação de alvos moleculares em patógenos prioritários multirresistentes. Graduada em Ciências Biológicas pela Universidade de São Paulo, tive a oportunidade de estagiar no Laboratório de Genética Molecular de Plantas Cultivadas da ESALQ/USP desde o início da minha graduação, com bolsas PIBIC e FAPESP. Fui a primeira bióloga a receber o prêmio Friedrich Gustav Brieger, em reconhecimento ao meu desempenho na área de Genética.